Богата колекция в разделите Палеонтология, Минералогия и Ботаника. Няколко зали са посветени на животинския свят, а приземният етаж разполага с най-големия сладководен аквариум в страната - с над 40 вида декоративни риби и няколко амфибии. Особено ценна е колекцията на минерали от Родопите.